Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXD4Q12950 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms