Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms