Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRCP08575 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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