Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms