Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms