Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCBE1Q6UXH8 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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