Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TRBV23OR9-2-201ENST00000390389 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SPACA3-203ENST00000394638 508 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FANCL-204ENST00000403676 849 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00378-201ENST00000413402 403 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HCG21-204ENST00000419481 605 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092100.1-203ENST00000421513 653 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005588.1-201ENST00000439168 162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MEG8-205ENST00000442197 625 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005532.1-203ENST00000447039 626 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TRAF3IP3-212ENST00000477431 791 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL12P42-201ENST00000481802 499 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02213-201ENST00000504650 518 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC114812.3-201ENST00000509542 730 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC006160.1-201ENST00000511010 750 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003031.2-201ENST00000533945 573 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01387-201ENST00000584361 603 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC023855.1-201ENST00000585899 359 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP001357.2-201ENST00000586758 710 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC098847.2-202ENST00000592549 959 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC011416.3-201ENST00000603971 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC118282.4-201ENST00000623090 1712 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms