Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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