Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms