Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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