Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms