Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms