Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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