Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 ADAM2-202ENST00000347580 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 NOS2-202ENST00000621962 3345 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRHP20396 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SLC9B2-203ENST00000503103 1911 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 TP63-210ENST00000440651 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRHP20396 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 TRIM51EP-201ENST00000524374 1516 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC011365.1-201ENST00000522615 3478 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC087762.2-201ENST00000639346 3773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRHP20396 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 PDE6H-201ENST00000266395 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRHP20396 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms