Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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RFXAPO00287 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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RFXAPO00287 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RFXAPO00287 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RFXAPO00287 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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RFXAPO00287 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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