Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
POLKQ9UBT6 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms