Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms