Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SRRTQ9BXP5 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SRRTQ9BXP5 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms