Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
COG3Q96JB2 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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