Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms