Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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