Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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