Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TRIP13Q15645 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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