Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms