Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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