Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms