Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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