Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 KATNAL2-201ENST00000245121 2833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MSL3P1-201ENST00000438684 2032 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TBX5-201ENST00000310346 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC01258-201ENST00000512517 2059 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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MKRN3Q13064 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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