Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXF2Q12947 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXF2Q12947 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXF2Q12947 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXF2Q12947 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXF2Q12947 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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