Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MCCD1P59942 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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