Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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