Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms