Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms