Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms