Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms