Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms