Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMIEQ8NEW7 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms