Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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