Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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DTX3Q8N9I9 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
DTX3Q8N9I9 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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