Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHLHA9Q7RTU4 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BHLHA9Q7RTU4 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHA9Q7RTU4 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms