Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RAB6CQ53S08 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RAB6CQ53S08 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RAB6CQ53S08 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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