Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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