Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NREPQ16612 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NREPQ16612 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms