Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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