Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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TRIP13Q15645 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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TRIP13Q15645 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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TRIP13Q15645 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIP13Q15645 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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