Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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COL4A6Q14031 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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COL4A6Q14031 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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