Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BPTFQ12830 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BPTFQ12830 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms