Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms