Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms