Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms